此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅马赛克。
生物导体版本:3.10
该软件包提供了拟合马赛克和马赛克hmm的功能,这是一个统计框架,用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或两样本芯片seq数据。
作者:Dongjun Chung,Pei Fen Kuan,Rene Welch,Sunduz Keles
维护者:dongjun chung
引用(从r内,输入引用(“马赛克”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ Mosaics”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“马赛克”)
R脚本 | 马赛克 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,chipseq,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 2.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(9年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 3.0.0),方法,图形,RCPP |
进口 | 大量的,花键,格子,,,,iranges,,,,基因组机,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS |
链接 | RCPP |
建议 | mosaicsexample |
系统要求 | 珀尔 |
增强 | 平行 |
URL | http://groups.google.com/group/mosaics_user_group |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Mosaics_2.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | Mosaics_2.24.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Mosaics_2.24.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/马赛克 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/ |
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