此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见miRLAB.
Bioconductor版本:3.10
提供探索miRNA- mrna关系的工具,包括流行的miRNA靶标预测方法,集成单个方法的集成方法,从在线资源获取数据的函数,验证结果的函数,以及进行富集分析的函数。
作者:Thuc Duy Le,张俊鹏,陈默,范越煌
维护人员:Thuc Duy Le
引文(从R内,输入引用(“miRLAB”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("miRLAB")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“miRLAB”)
超文本标记语言 | R脚本 | miRLAB |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,网络,NetworkInference,软件,microrna的 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | 方法,统计,效用,RCurl,httr,stringr,Hmisc,能源,熵,Roleswitch,gplots,glmnet,嫁祸于,limma,pcalg,TCGAbiolinks,dplyr,SummarizedExperiment,ctc,heatmap.plus,InvariantCausalPrediction,类别,GOstats,org.Hs.eg.db |
链接 | |
建议 | knitr,BiocGenerics,AnnotationDbi,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pvvhoang/miRLAB |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | miRLAB_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | miRLAB_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | miRLAB_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRLAB |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRLAB/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |