miRLAB

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRLAB

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见miRLAB

探索miRNA-mRNA关系的干燥实验室

Bioconductor版本:3.10

提供探索miRNA- mrna关系的工具,包括流行的miRNA靶标预测方法,集成单个方法的集成方法,从在线资源获取数据的函数,验证结果的函数,以及进行富集分析的函数。

作者:Thuc Duy Le,张俊鹏,陈默,范越煌

维护人员:Thuc Duy Le

引文(从R内,输入引用(“miRLAB”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("miRLAB")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“miRLAB”)

超文本标记语言 R脚本 miRLAB
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression网络NetworkInference软件microrna的
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口 方法,统计,效用,RCurlhttrstringrHmisc能源Roleswitchgplotsglmnet嫁祸于limmapcalgTCGAbiolinksdplyrSummarizedExperimentctcheatmap.plusInvariantCausalPrediction类别GOstatsorg.Hs.eg.db
链接
建议 knitrBiocGenericsAnnotationDbiRUnit
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pvvhoang/miRLAB
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 miRLAB_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 miRLAB_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) miRLAB_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRLAB
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRLAB/
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