methyvim

DOI:10.18129 / B9.bioc.methyvim

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅methyvim。

有针对性的、健壮的、模范自由差异甲基化分析

Bioconductor版本:3.10

这个包提供了基于变量重要性的差异甲基化分析设施措施(VIMs),一类统计目标参数出现在因果推论。非参数估计和推理过程提供,依靠整体机器学习灵活评估功能协变量之间的关系和利益的结果。这些工具可应用于微分甲基化水平的CpG网站,获取有效的多重假设检验的统计推断即使改正。

赫亚兹作者:尼玛(cre, aut cph],蕾切尔菲利普斯(施)黑色范德朗,马克(aut)艾伦·哈伯德(施,黑色)

赫亚兹维护者:尼玛< nh nimahejazi.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“methyvim”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	目标Data-Adaptive估计和推断差异甲基化分析
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