methylCC

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylCC

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见methylCC．

估计DNA甲基化样本中全血的细胞组成

Bioconductor版本:3.10

在任何平台技术(微阵列和测序)上测量的DNA甲基化全血样本的细胞组成的估计工具。

作者:Stephanie C. Hicks [aut, cre]，拉斐尔·伊里扎里[au]

维护人员:Stephanie C. Hicks

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("methylCC")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“methylCC”)

超文本标记语言	R脚本	qsmooth用户指南
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文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，MethylSeq，MethylationArray，微阵列，测序，软件，WholeGenome
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月)
许可证	CC 4.0
取决于	R (> = 3.6),FlowSorted.Blood.450k
进口	Biobase，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，dplyr，magrittr，minfi，bsseq，quadprog，plyranges,统计,跑龙套,bumphunter，genefilter、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
链接
建议	knitr，testthat(> =魅惑,BiocGenerics，BiocStyle，tidyr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
BugReports	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	methylCC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	methylCC_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	methylCC_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylCC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methylCC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylCC/
包下载报告	下载数据