甲基

doi:10.18129/b9.bioc.methimphute

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅甲基

WGB数据中完全甲基团的插定引导重建

生物导体版本:3.10

该软件包实现了用于调用基因组所有细胞肽的甲基化的功能。

作者:亚伦·塔德(Aaron Taudt)

维护者:aaron taudt

引用(从r内,输入引用(“ methimpute”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ methimpute”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Methimpute”)

PDF R脚本 甲基化状态用methimpute呼唤
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,HiddenMarkovModel,,,,免疫学,,,,测序,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.4.0),基因组机,,,,GGPLOT2
进口 RCPP(> = 0.12.4.5),方法,UTILS,GRDEVICES,Stats,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,生物弦,,,,RESHAPE2,,,,minpack.lm,,,,Data.Table
链接 RCPP
建议 尼特,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 methimpute_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 methimpute_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) methimpute_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methimpute
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/methimpute
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methimpute/
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