metaseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metaseqR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见metaseqR．

通过组合多种统计算法，用于RNA-Seq数据的分析和结果报告的R包。

Bioconductor版本:3.10

为RNA-Seq基因表达数据提供几个标准化和统计测试包的接口。此外，它还创建了几个诊断图，通过结合几个统计测试的结果进行元分析，并以交互式方式报告结果。

作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

维护者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("metaseqR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“metaseqR”)

PDF	R脚本	使用metaseqR的多种统计算法进行RNA-Seq数据分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，预处理，质量控制，RNASeq，ReportWriting，软件，WorkflowStep
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(6年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 2.13.0)，EDASeq，DESeq，limma，qvalue
进口	刨边机，NOISeq，baySeq，NBPSeq，biomaRt跑龙套,gplots，corrplot，vsn，酿造，rjson，log4r
链接
建议	BiocGenerics，GenomicRanges，rtracklayer，Rsamtools，survcomp，维恩图，knitr，动物园，RUnit，BiocManager，BSgenome，RSQLite
SystemRequirements
增强了	平行,移行细胞癌，RMySQL
URL	http://www.fleming.gr
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	metaseqR_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	metaseqR_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	metaseqR_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metaseqR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/
软件包下载报告	下载数据