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墨西拿
DOI:10.18129 / B9.bioc.messina
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅墨西拿。
单基因分类器和outlier-resistant检测双官能团的微分表达式和生存问题。
Bioconductor版本:3.10
梅西纳是一家集算法构造最优健壮的单基因分类器,和微分表达式识别异常值的存在或未知样本子组。方法应用程序在识别导致功能发展为临床试验(包括诊断和预后),和确定微分表达式时的一小部分样本显示不同寻常的表达模式。
作者:马克Pinese (aut),马克Pinese (cre),马克Pinese (cph)
维护人员:马克Pinese < m。在garvan.org.au pinese >
从内部引用(R,回车引用(“墨西拿”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“墨西拿”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“墨西拿”)
| R脚本 | 使用墨西拿 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics,分类,DifferentialExpression,GeneExpression,软件,生存 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(6年) |
| 许可证 | EPL (> = 1.0) |
| 取决于 | R (> = 3.1.0),生存(> = 2.37 4)方法 |
| 进口 | Rcpp(> = 0.11.1),plyr(> = 1.8),ggplot2(> = 0.9.3.1)、网格(> = 3.1.0),foreach(> = 1.4.1),图形 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr(> = 1.5),antiProfilesData(> = 0.99.2),Biobase(> = 2.22.0),BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | doMC(> = 1.3.3) |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | messina_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | messina_1.22.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | messina_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/messina |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/墨西拿 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/messina/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
