maftools
doi：10.18129/b9.bioc.maftools
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅maftools。
总结，分析和可视化MAF文件
生物导体版本：3.10
分析和可视化大规模测序研究中的突变注释格式（MAF）文件。该软件包提供了各种功能，可以在癌症基因组学中执行最常用的分析，并以最少的精力创建功能丰富的可定制视觉量。
作者：Anand Mayakonda [AUT，CRE]
维护者：Anand Mayakonda
引用（从r内，输入引用（“ maftools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ maftools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Maftools”）
| html | R脚本 | 01：总结，分析和可视化MAF文件 |
| html | R脚本 | 02：自定义OnCoplots |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，dnaseq，，，，datarepresentation，，，，驱动器，，，，特征提取，，，，功能基因组学，，，，测序，，，，软件，，，，somaticmmut，，，，生存，，，，变体，，，，可视化 |
| 版本 | 2.2.10 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（3.5岁） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.3） |
| 进口 | Data.Table，，，，rcolorbrewer， 方法，WordCloud，grdevices，生存 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，BSGENOME，，，，生物弦，，，，NMF，，，，mclust |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/poisonalien/maftools |
| BugReports | https://github.com/poisonalien/maftools/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | tcgabiolinksgui，，，，tcgaworkflow |
| 建议我 | 幸存，，，，tcgabiolinks |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | maftools_2.2.2.10.tar.gz |
| Windows二进制 | maftools_2.2.2.10.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | maftools_2.2.2.10.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/maftools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/maftools |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/maftools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
