Lionessr

doi：10.18129/b9.bioc.lionessr

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Lionessr。

使用母狮为单个样品建模网络

生物导体版本：3.10

母狮或线性插值以获得单个样本的网络估计值，可用于重建单样本网络（https://arxiv.org/abs/1505.06440）。该代码在R中的母狮功能中实现了母狮方程，以重建单样本网络。我们使用的默认网络重建方法基于Pearson相关性。但是，Lionessr可以在任何网络重建算法上运行，该算法返回完整的加权邻接矩阵。Lionessr为Unipertite和双方网络工作。

作者：Marieke Lydia Kuijjer [aut]，ping-han hsieh [cre]

维护者：ping-han hsieh

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ lionessr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Lionessr”）

html	R脚本	Lionessr
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	基因表达，，，，网络，，，，网络引导，，，，软件
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.6.0）
进口	统计，总结性特征，，，，S4VECTORS
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，Igraph，，，，RESHAPE2，，，，林玛
系统要求
增强
URL	https://github.com/mararie/lionessr
BugReports	https://github.com/mararie/lionessr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	lionessr_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	lionessr_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	Lionessr_1.0.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lionessr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/lionessr
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/lionessr/
软件包下载报告	下载统计