林马

DOI：10.18129 / b9.bioc.limma.

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微阵列数据的线性模型

生物导体版本：3.10

微阵列数据的数据分析，线性模型和差异表达。

作者：Gordon Smyth [Cre，Aut]，Yifang Hu [CTB]，Matthew Ritchie [CTB]，Jeremy Silver [CTB]，James Wettenhall [CTB]，Davis McCarthy [CTB]，Di Wu [CTB]，Wei Shi [CTB]，Belinda Phiveon [CTB]，Aaron Lun [CTB]，Natalie Thorne [CTB]，Alicia Oshlack [CTB]，Carolyn de Graf [CTB]，Yunshun Chen [CTB]，Mette Langaas [CTB]，Egil Ferkingstad [CTB]，Marcus Davy [CTB]，Francois Pepin [CTB]，Dongseok Choi [CTB]

维护者：Gordon Smyth

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细节

Biocviews.	替代品那batcheffect.那贝叶斯那BioMeDicalInformatics那细胞生物学那化学信息学那聚类那DataImport.那不同的亚兴那差异化那表观遗传学那Exonarray.那官能组学那基因表达那GenesetenRichment.那遗传学那免疫学那代谢组学那microRNAARRAY.那微阵列那多匹匹莫森那正常化那oneChannel.那预处理那proprietaryplatforms.那蛋白质组学那QualityControl.那rnaseq.那回归那测序那软件那系统生物学那时间课程那转录那转录组学那两种通道那MRAMICRARARAY.
版本	3.42.2
在生物导体中以来	BIOC 1.6（R-2.1）或更早版本（> 15年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.6.0）
进口	Grdevices，图形，统计数据，Util，方法
链接到
建议	敬服那annotationdbi.那百瑞德那BioBase.那椭圆那go.db.那贡献那Illuminaio那Locfit.那大量的那org.hs.eg.db.，花键，Statmod.（> = 1.2.2），VSN.
系统要求
加强
URL.	http://bioinf.wehi.edu.au/limma.
取决于我	A4Base.那yeasyExpress.那Agimicrorna.那比希拉那布尔玛那索布尔那CCL4.那CGHMCR.那chimphumanbraindata.那Clippda.那Codelink.那兑换那cormotif那迪科那DEQMS.那药物潜行酶那edger.那EGSEA123那eximir.那表达式那FEM那fletcher2013a.那GCMAP.那Genefu.那HD2013SGI.那htqpcr.那IsoformSwitchAnalyzer.那牧师那maigespack.那mapredictdsc.那马拉莱那MetagenomeSQ.那metaseqr.那甲基疗法arrayAlysis.那mmpalatemirna.那MPRA.那QPcrnorm.那QUusage.那rbm.那Reactomegsa.data.那林诺那RNASEQ123那rnbeads.那rnits.那泼丝体那SRGNET.那SSPA.那翻译那马托姆大陆那variancepartition.那西瓜
进口我	ABSSEQ.那倍感工具那聘请圭圭那amaretto.那Anamir.那蚕豆那Anota2seq.那ArrayExpress.那ressquality.那ArrayqualityMetrics.那ArrayTools.那艺术品那aspediafi.那Atacseqqc.那吸引那适华那舞会礼服那Batchqc.那Beadarray那beadarrayusecases.那生物墨呢那BIRTE.那BSSeq.那Bubbletree.那Bumphunter.那索布尔那癌变分析那癌症那卡斯珀那催化剂那冠军那浮雕那Chippeakanno.那丁浓缩那cnvranger.那coexnet.那Compcoder.那承认那共识那达人古怪那countblust.那CRLMM.那cross那Crossmeta.那CSAW.那Ctrap.那CTSGE.那Damireseq.那达巴马尔那德布雷斯勒那张那derfinderplot那去掉那困惑那diffcyt.那Diffhic.那差异那Dmelsgi.那dmrcate.那Doscheda.那德里姆瑟克那EBSEA.那EEGC.那埃拉德那EGSEA.那enrichmentbrowser.那erccdashboard.那eventPointer.那探索酶那ExpressionNormalizationWorkflow.那流动那fl那Gcrisprtools.那gdcrnatools.那geneselectmmd.那地理曲线那GGBase.那Gosummaries.那gqtlstats.那GUIDESEQ.那Hipathia.那htqpcr.那冰茶那icheck.那ichip.那Icobra.那理想的那inpas.那Isomirs.那Mobsseq.那Limmagui.那Linnorm.那lipidr.那lmdme.那lvsmirna.那mapkl.那MBQN.那McSea.那一顿饭那Methylkit.那甲基混合物那Methyvim.那米格莎那Minfi.那米尔拉布那MissMethyl.那MLSEQ.那mmpalatemirna.那单片那moonlightr.那MSSTATS.那msstatstmt.那多atAdataset.那马斯喀特那Nadfinder.那NEM.那罚款那nondetects.那armanalyzerde.那OGSA.那奥林那omicrexposome.那OPPTI.那oveseg.那PAA.那牧伙伴那实证那PCAExplorer.那佩奇那百事可乐那幻想那现象那聚酯纤维那projectr.那Psichomics.那Pwrewas.那QPlexAnalyzer.那QSEA.那rcgh.那revountworkflow.那regsplice.那ReportingTools.那林诺那rnainteract.那rnaity那rtcgatoolbox.那rtn.那rtopper那烤那斯那Sepira.那seqsetvis.那秒杀那signaturesearchdata.那simbindprofiles.那singlecelltk.那snapcgh.那议案那SVA.那svaplsseq.那Systempiper.那tcgabiolinks.那时间课程那TimeSeriesexperiment.那Topaseq.那TPP.那转录图表那TVTB.那TweedeSeQ.那VSN.那扳手那山姆斯那纱
建议我	abarray.那AdacGH2.那阵列那beadarraysnp.那生物室那Bioccasestudies.那生物集那二乙衫那Bloodcancermultiomics2017那CageWorkflow.那类别那CompoundationCompare.那Celaref.那蜂窝状那cellmixs.那classifyr.那CMA.那COGPS.那Cydar.那重新评估那德内捷德那descan2.那染料纤维那弯头那FGSEA.那吐那geuvadistranscriptexpr.那光明那GSRI.那GSVA.那哈曼那散热那等待者那凡隘泻那l那李森林那lumi.那mammaprintdata.那桅杆那MDGSA.那弥撒那MLP.那NPGSEA.那oligo.那逆口那paxtoolsr.那PGSEA.那钢琴那PLW.那预先那博士那彪马那rcade.那rtopper那rtracklayer.那撒尿那七百年人那SimpleSingleCell.那stager.那潜艇那摘要博马克那TopConfects.那tximeta.那tximport.那毕验法那ZFPKM.
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