乔达
doi：10.18129/b9.bioc.joda
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅乔达。
使用知识来量化基因失调的JODA算法
生物导体版本：3.10
包装“ Joda”实现了称为Joda的算法的三个步骤。该算法计算基因放大管制评分。对于每个基因，其放松管制评分反映了某个调节剂对该基因的扰动的强烈影响，在两个不同的细胞群之间有所不同。该算法利用调节器敲低表达数据以及有关调节器所涉及的信号通路的知识（在简单的矩阵模型中正式化）。
作者：ewa szczurek
维护者：ewa szczurek
引用（从r内，输入引用（“ Joda”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ joda”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Joda”）
| R脚本 | Joda简介 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，网络引导，，，，途径，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 1.34.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.8（R-2.13）（9年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.0），BGMM，，，，rbgl |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | joda_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | joda_1.34.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | joda_1.34.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/joda |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/joda |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/joda/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
