imageHTS

DOI:10.18129 / B9.bioc.imageHTS

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见imageHTS．

基于高通量显微镜的屏幕分析

Bioconductor版本:3.10

imagets是一个R包，专门用于分析基于高通量显微镜的屏幕。该软件包提供了一个模块化和可扩展的框架来分割细胞，提取定量细胞特征，预测细胞类型和通过web界面浏览屏幕数据。imagets旨在在分布式环境中运行，提供了对远程数据的标准化访问，并促进了基于显微镜的高通量数据集的传播。

作者:Gregoire Pau, Zhang Xian, Michael Boutros, Wolfgang Huber

维护者:Joseph Barry < Joseph。Barry在embl.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“imageHTS”)

PDF	R脚本	基于imagets的高通量显微屏幕分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，ImmunoOncology，预处理，软件，可视化
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(9.5年)
许可证	lgpl - 2.1
取决于	R (>= 2.9.0)，EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0)
进口	工具,Biobase，hwriter、方法、vsn，统计，utils，e1071
链接
建议	BiocStyle，质量
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	imageHTS_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	imageHTS_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	imageHTS_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imageHTS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/imageHTS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/
软件包下载报告	下载数据