imageHTS

DOI:10.18129 / B9.bioc.imageHTS

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见imageHTS

基于高通量显微镜的屏幕分析

Bioconductor版本:3.10

imagets是一个R包,专门用于分析基于高通量显微镜的屏幕。该软件包提供了一个模块化和可扩展的框架来分割细胞,提取定量细胞特征,预测细胞类型和通过web界面浏览屏幕数据。imagets旨在在分布式环境中运行,提供了对远程数据的标准化访问,并促进了基于显微镜的高通量数据集的传播。

作者:Gregoire Pau, Zhang Xian, Michael Boutros, Wolfgang Huber

维护者:Joseph Barry < Joseph。Barry在embl.de>

引文(从R内,输入引用(“imageHTS”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“imageHTS”)

PDF R脚本 基于imagets的高通量显微屏幕分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssaysImmunoOncology预处理软件可视化
版本 1.36.0
在Bioconductor BioC 2.7 (R-2.12)(9.5年)
许可证 lgpl - 2.1
取决于 R (>= 2.9.0),EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0)
进口 工具,Biobasehwriter、方法、vsn,统计,utils,e1071
链接
建议 BiocStyle质量
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 imageHTS_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 imageHTS_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) imageHTS_1.36.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imageHTS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/imageHTS
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/
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