illuminaio

DOI:10.18129 / B9.bioc.illuminaio

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅illuminaio

解析Illumina公司微阵列输出文件

Bioconductor版本:3.10

工具解析Illumina公司的微阵列输出文件,包括IDAT。

作者:凯斯·巴格利(aut),亨利克·本特松(aut) Kasper丹尼尔·汉森(aut (cre),马特·里奇(aut),迈克·l·史密斯(aut)蒂姆Triche Jr .)(施)

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“illuminaio”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“illuminaio”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“illuminaio”)

PDF 加密IDAT格式的描述
PDF R脚本 介绍illuminaio
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,基础设施,微阵列,ProprietaryPlatforms,软件
版本 0.28.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(7年)
许可证 GPL-2
取决于
进口 base64
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,IlluminaDataTestFiles(> = 1.0.2中),BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio
BugReports https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio/issues
取决于我 EGSEA123,normalize450K,RnBeads,西瓜
进口我 beadarray,冠军,crlmm,ENmix,methylumi,minfi,芝麻
建议我 limma
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 illuminaio_0.28.0.tar.gz
Windows二进制 illuminaio_0.28.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) illuminaio_0.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ illuminaio
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/illuminaio/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网