此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅我明白。
生物导体版本:3.10
提供了创建基于交互式闪亮的图形用户界面的功能,用于探索存储在摘要的expperiment对象(包括行和列级元数据)中的数据。特别关注单链体对象中的单细胞数据,并可视化降低降低结果。
作者:Kevin Rue-Albrecht [aut],费德里科·马里尼[AUT],夏洛特·索森[AUT,CRE],亚伦·伦[自动]
维护者:charlotte soneson
引用(从r内,输入引用(“ isee”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ isee”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ isee”)
html | R脚本 | 1. ISEE用户指南 |
html | R脚本 | 2.实验colormap类 |
html | R脚本 | 3.配置ISEE应用程序 |
html | R脚本 | 4.部署自定义面板 |
html | R脚本 | 5.语音识别 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,聚类,,,,维度,,,,特征提取,,,,GUI,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,可视化 |
版本 | 1.6.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(2年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | 总结性特征,,,,Singlecellexperiment |
进口 | 方法,生物基因,,,,S4VECTORS,utils,统计,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,闪亮,,,,Shinyjs,,,,DT,,,,Rintrojs,,,,GGPLOT2,,,,颜色,,,,Igraph,,,,蛇,,,,MGCV,,,,RESHAPE2,,,,Rentrez,,,,AnnotationDbi,图形,grdevices,Viridislite,,,,牛仔图,,,,秤,,,,dplyr |
链接 | |
建议 | 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,scrnaseq,,,,评分,,,,延迟(> = 0.7.44),RTSNE,,,,irlba,,,,rcolorbrewer,,,,维里迪斯,,,,org.mm.eg.db,,,,htmltools |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/csoneson/isee |
BugReports | https://github.com/csoneson/isee/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | DuoClustering2018,,,,HCADATA,,,,Schex,,,,Tabulamurisdata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | isee_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | isee_1.6.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | isee_1.6.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isee |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/isee |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/isee/ |
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