我明白

doi:10.18129/b9.bioc.isee

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅我明白

交互式总结性浏览器

生物导体版本:3.10

提供了创建基于交互式闪亮的图形用户界面的功能,用于探索存储在摘要的expperiment对象(包括行和列级元数据)中的数据。特别关注单链体对象中的单细胞数据,并可视化降低降低结果。

作者:Kevin Rue-Albrecht [aut],费德里科·马里尼[AUT],夏洛特·索森[AUT,CRE],亚伦·伦[自动]

维护者:charlotte soneson

引用(从r内,输入引用(“ isee”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ isee”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ isee”)

html R脚本 1. ISEE用户指南
html R脚本 2.实验colormap类
html R脚本 3.配置ISEE应用程序
html R脚本 4.部署自定义面板
html R脚本 5.语音识别
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,聚类,,,,维度,,,,特征提取,,,,GUI,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,可视化
版本 1.6.1
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(2年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 总结性特征,,,,Singlecellexperiment
进口 方法,生物基因,,,,S4VECTORS,utils,统计,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,闪亮,,,,Shinyjs,,,,DT,,,,Rintrojs,,,,GGPLOT2,,,,颜色,,,,Igraph,,,,,,,,MGCV,,,,RESHAPE2,,,,Rentrez,,,,AnnotationDbi,图形,grdevices,Viridislite,,,,牛仔图,,,,,,,,dplyr
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,scrnaseq,,,,评分,,,,延迟(> = 0.7.44),RTSNE,,,,irlba,,,,rcolorbrewer,,,,维里迪斯,,,,org.mm.eg.db,,,,htmltools
系统要求
增强
URL https://github.com/csoneson/isee
BugReports https://github.com/csoneson/isee/issues
取决于我
进口我
建议我 DuoClustering2018,,,,HCADATA,,,,Schex,,,,Tabulamurisdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 isee_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 isee_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) isee_1.6.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isee
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/isee
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/isee/
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