hiAnnotator

DOI:10.18129 / B9.bioc.hiAnnotator

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hiAnnotator

函数注释农庄组织对象

Bioconductor版本:3.10

hiAnnotator包含组函数允许用户注释农庄组织与自定义对象的注释。这个包的基本哲学是两个农庄对象(查询&主题)与普通组seqnames(即染色体)并返回相关的注释/ seqnames和行从查询匹配seqnames和行(即基因或cpg岛)。包有三种类型的注释函数计算如果位置查询的方法是:在一个特性,特性,附近或统计特性在定义窗口大小。此外,每个函数配备并行端使用foreach包。此外,包配有包装器函数,发现适当的列需要一个农庄对象从一个公共的数据帧。

作者:Nirav V Malani < malnirav gmail.com >

维护人员:Nirav V Malani < malnirav gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“hiAnnotator”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“hiAnnotator”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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文本 新闻

细节

biocViews 注释,软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(5.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 GenomicRangesR (> = 2.10)
进口 foreach,迭代器,rtracklayer,dplyr,BSgenome,ggplot2,尺度、方法
链接
建议 knitr,doParallel,testthat,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 hiReadsProcessor
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 hiAnnotator_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 hiAnnotator_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) hiAnnotator_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hiAnnotator
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hiAnnotator
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/hiAnnotator/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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