这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅的热图。
Bioconductor版本:3.10
这个包提供函数来绘制的热图跨基因组的全基因组数据的间隔,如ChIP-seq信号的峰值和推动者。许多功能也提供调查序列特性。
作者:马尔科姆·佩里在gmail.com < mgperry32 >
维护人员:马尔科姆·佩里在gmail.com < mgperry32 >
从内部引用(R,回车引用(“热图”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“热图”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“热图”)
HTML | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | FunctionalGenomics,SequenceMatching,软件,可视化 |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.4) |
进口 | 方法、grDevices图形,统计数据,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix,矩阵,EBImage,RColorBrewer,BiocGenerics,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | heatmaps_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | heatmaps_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | heatmaps_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/heatmaps |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/热图 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/heatmaps/ |
包下载报告 | 下载数据 |