h5vc

DOI:10.18129 / B9.bioc.h5vc

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅h5vc。

使用hdf5后台管理校准记录

Bioconductor版本:3.10

这个包包含函数从门店实验与统计数据存储在HDF5文件。

作者:保罗·西奥多·所有

维护人员:保罗西奥多·所有< paul.theodor。所有gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“h5vc”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“h5vc”)

HTML	R脚本	建立一个最小基因组浏览器h5vc和闪亮的
HTML	R脚本	h5vc——旅游
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	2.20.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(6.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	网格,gridExtra,ggplot2
进口	rhdf5,重塑,S4Vectors,IRanges,Biostrings,Rsamtools(> = 1.99.1)、方法GenomicRanges,abind,BiocParallel,BatchJobs,h5vcData,GenomeInfoDb
链接	Rhtslib(> = 1.15.3)
建议	knitr,locfit,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,biomaRt,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	h5vcData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	h5vc_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	h5vc_2.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	h5vc_2.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/h5vc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ h5vc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/h5vc/
包下载报告	下载数据