Gscreend

doi：10.18129/b9.bioc.gscreend

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Gscreend。

合并遗传筛选的分析

生物导体版本：3.10

用于分析合并遗传筛查的包装（例如CRISPR-KO）。此类筛选的分析基于细胞增殖阶段之前和之后的GRNA丰度的比较。Gscreend包装将GRNA计数作为输入，并允许检测其敲除的基因减少或增加细胞增殖。

作者：Katharina Imkeller [CRE，AUT]，Wolfgang Huber [AUT]

维护者：dkfz.de>的katharina imkeller

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gscreend”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Gscreend”）

html	R脚本	example_simulated
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	CRISPR，，，，合并屏幕，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.6）
进口	总结性特征，，，，nloptr，，，，fgarch， 方法，生物比较，图形
链接
建议	尼特，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://github.com/imkeller/gscreend
BugReports	https://github.com/imkeller/gscreend/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	gscreend_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	gscreend_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	gscreend_1.0.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gscreend
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/gscreend
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/gscreend/
软件包下载报告	下载统计