goseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.goseq

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见goseq．

用于RNA-seq和其他长度偏倚数据的基因本体分析器

Bioconductor版本:3.10

检测基因本体和/或其他在RNA-seq数据中过度/不足的用户定义类别

作者:马修·杨

维护者:Matthew Young ， Nadia Davidson < Nadia。戴维森在McRi.edu.au >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("goseq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“goseq”)

PDF	R脚本	goseq用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，转录
版本	1.38.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(10年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.11.0)，BiasedUrn，geneLenDataBase(> = 1.9.2)
进口	mgcv，图形，统计，utils，AnnotationDbi，GO.db，BiocGenerics
链接
建议	刨边机，org.Hs.eg.db，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	rgsepd
进口我	冠军，理想的，PathwaySplice，击杀
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	goseq_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	goseq_1.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	goseq_1.38.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/goseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/goseq/
软件包下载报告	下载数据