ggcyto

doi:10.18129/b9.bioc.ggcyto

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅ggcyto

使用GGPLOT可视化细胞术数据

生物导体版本:3.10

通过针对Flowset,NCDFFLOWSET和Gatingset类实施的专用强化方法,可以用GGPLOT直接绘制原始和门控流式细胞术数据。GGCYTO包装纸和一些定制层也使得在该图中添加大门和人口统计数据变得容易。

作者:迈克·江

维护者:Mike Jiang

引用(从r内,输入引用(“ ggcyto”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ggcyto”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ggcyto”)

html R脚本 GGCYTO的功能摘要
html R脚本 快速的细胞仪数据图
html R脚本 用ggcyto可视化流量
html R脚本 用ggcyto可视化gatingset
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化
版本 1.14.1
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4年)
执照 艺术2.0
要看 方法,GGPLOT2(> = 3.3.0),流核(> = 1.41.5),ncdfflow(> = 2.17.1),FlowWorkspace(> = 3.33.1)
进口 plyr,,,,,,,,Data.Table,,,,rcolorbrewer,,,,栅格,,,,rlang
链接
建议 测试,,,,FlowWorkspacedata,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,FlowStats,,,,opencyto,,,,Flowviz,,,,Ggridges,,,,VDIFFR
系统要求
增强
URL https://github.com/rglab/ggcyto/issues
取决于我
进口我 细胞瘤
建议我 流核,,,,FlowWorkspace,,,,opencyto
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ggcyto_1.14.1.tar.gz
Windows二进制 ggcyto_1.14.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ggcyto_1.14.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggcyto
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ggcyto
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ggcyto/
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