Genotypeeval
doi：10.18129/b9.bioc.genotypeeval
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Genotypeeval。
GVCF或VCF文件的QA/QC
生物导体版本：3.10
使用GVCF或VCF并报告指标以评估呼叫质量。
作者：詹妮弗·汤姆[AUT，CRE]
维护者：jennifer tom
引用（从r内，输入引用（“ Genotypeeval”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ genotypeeval”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Genotypeeval”）
| html | genotypeeval_vignette.html | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，DataImport，，，，遗传学，，，，SNP，，，，测序，，，，软件，，，，变体 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.2（R-3.2）（4。5年） |
| 执照 | 文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.4.0），变体 |
| 进口 | GGPLOT2，，，，rtracklayer，，，，生物基因，，，，基因组机，，，，GenomeInfodB，，，，iranges， 方法，生物比较，图形，统计 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkDown，，，，测试，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | genotypeeval_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | genotypeeval_1.18.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | genotypeeval_1.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genotypeeval |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/genotypeeval |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genotypeeval/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
