此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见genomeIntervals.
Bioconductor版本:3.10
这个包定义了表示基因组间隔的类,并提供了处理这些间隔的函数和方法。注意:该包为'girafe'包提供了基本的基础设施,并由'girafe'包进行了增强。
作者:Julien Gagneur < Gagneur at genzentrum. lmmu .de>, Joern Toedling, Richard Bourgon, Nicolas Delhomme
维护者:Julien Gagneur < Gagneur at genzentrum.lmu.de>
引文(从R内,输入引用(“genomeIntervals”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install(" genomeinterval ")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“genomeIntervals”)
R脚本 | genomeinterval包概述。 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,遗传学,基础设施,软件 |
版本 | 1.42.0 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(11年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.15.0),方法,时间间隔(> = 0.14.0),BiocGenerics(> = 0.15.2) |
进口 | GenomeInfoDb(> = 1.5.8),GenomicRanges(> = 1.21.16),IRanges(> = 2.3.14),S4Vectors(> = 0.7.10) |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | girafe |
进口我 | easyRNASeq |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | genomeIntervals_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | genomeIntervals_1.42.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | genomeIntervals_1.42.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomeIntervals |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ genomeinterval |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/genomeIntervals/ |
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