geNetClassifier

DOI:10.18129 / B9.bioc.geNetClassifier

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅geNetClassifier

疾病分类和构建基因网络使用相关基因表达谱

Bioconductor版本:3.10

综合方案自动训练和验证一个多层次SVM分类器基于基因表达数据。提供透明的选择的基因标记,coexpression网络,查询分类器的接口。

作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo和哈维尔·De Las里瓦斯。生物信息学与功能基因组学。癌症研究中心(CiC-IBMCC CSIC / USAL)。萨拉曼卡。西班牙。

维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >

从内部引用(R,回车引用(“geNetClassifier”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geNetClassifier”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“geNetClassifier”)

PDF R脚本 geNetClassifier-vignette
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类,DifferentialExpression,微阵列,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(7年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.10.1),Biobase(> = 2.5.5),EBarrays,minet、方法
进口 e1071、图形
链接
建议 leukemiasEset,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了 RColorBrewer,igraph,infotheo
URL http://www.cicancer.org
取决于我
进口我 bioCancer,癌症
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 geNetClassifier_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 geNetClassifier_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) geNetClassifier_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geNetClassifier
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geNetClassifier
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/geNetClassifier/
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