gaga

DOI:10.18129 / B9.bioc.gaga

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gaga。

GaGa层次模型为高通量数据分析

Bioconductor版本:3.10

实现了GaGa高通量数据分析模型,包括微分表达式分析、监督基因聚类和分类。此外,它执行顺序样本量计算使用GaGa和LNNGV模型从EBarrays包(后者)。

作者:大卫Rossell < rosselldavid gmail.com >。

维护人员:大卫Rossell < rosselldavid gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“嘎嘎”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“嘎嘎”)

PDF	R脚本	手册gaga图书馆
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,DifferentialExpression,ImmunoOncology,MassSpectrometry,MultipleComparison,OneChannel,软件
版本	2.32.0
Bioconductor自	BioC 2.2 (r - 2.7)(12年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.8.0),Biobase,coda,EBarrays,mgcv
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我	卡斯珀
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	gaga_2.32.0.tar.gz
Windows二进制	gaga_2.32.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	gaga_2.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gaga
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gaga
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gaga/
包下载报告	下载数据