flowWorkspace

DOI:10.18129 / B9.bioc.flowWorkspace

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见flowWorkspace．

表示门控和非门控细胞术数据集并与之交互的基础设施。

Bioconductor版本:3.10

这个包的设计是为了方便比较自动门控方法和在flowJo中进行的手动门控方法。这个包允许您将基本的flowJo工作区导入到BioConductor中，并使用flowCore功能从flowJo复制门控。将执行门控层次结构、样本组、补偿和转换，以便输出与flowJo分析匹配。

作者:Greg Finak, Mike Jiang

维护者:Greg Finak ，Mike Jiang

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“flowWorkspace”)

超文本标记语言	R脚本	flowWorkspace简介:一个用于存储和操作门控流数据的包
超文本标记语言	R脚本	如何合并GatingSets
超文本标记语言	R脚本	如何绘制门控数据
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文本		安装

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，预处理，软件
版本	3.34.1
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	Biobase，BiocGenerics，图，图形，grDevices，晶格，方法，统计，stats4, utils，RBGL、工具、gridExtra，Rgraphviz，data.table，dplyr，latticeExtra，Rcpp，RColorBrewer，stringr，尺度，flowViz，matrixStats，消化，RcppParallel，flowCore(> = 1.51.4),ncdfFlow(> = 2.31.1)
链接	Rcpp，黑洞(> = 1.62.0-1),RProtoBufLib(> = 1.7.1上),cytolib(> = 1.7.4),RcppParallel
建议	testthat，flowWorkspaceData，knitr，ggcyto平行,CytoML，openCyto
SystemRequirements	GNU制作，c++ 11
增强了
URL
全靠我	ggcyto，highthroughputassays，限定符
进口我	CytoML，flowDensity，FlowSOM，flowStats，ImmuneSpaceR，openCyto，限定符
建议我	指南针，flowClust，flowCore
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	flowWorkspace_3.34.1.tar.gz
Windows二进制	flowWorkspace_3.34.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	flowWorkspace_3.34.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowWorkspace
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flowWorkspace
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowWorkspace/
软件包下载报告	下载数据