flowspy

doi：10.18129/b9.bioc.flowspy

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅flowspy。

用于流量和质量细胞仪数据的工具包

生物导体版本：3.10

用于流量和质量细胞术数据的轨迹推理和可视化工具包。Flowspy为流量和质量细胞仪数据提供了完整的分析工作流程。Flowspy可以是应用程序的有价值的工具，从降低聚类和维度重建到流量和质量细胞仪数据的轨迹重建和伪期权估计。

作者：Yuting Dai [AUT，CRE]

维护者：在sjtu.edu.cn>的dai

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ flowspy”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ flowspy”）

html	R脚本	快速开始
PDF		quick_start_of_flowspy.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	蜂窝基，，，，细胞生物学，，，，聚类，，，，流程仪，，，，网络，，，，网络引导，，，，软件，，，，可视化
版本	1.0.4
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.6），Igraph
进口	流动，，，，RTSNE，，，，GGPLOT2，，，，命运，，，，Gmodels，，，，流动性，，，，生物酶，，，，矩阵，，，，流核，，，，SVA，，，，矩阵， 方法，mclust，，，，Prettydoc，，，，拉恩（> = 2.5），RCPP（> = 0.12.0），生物脑，，，，簇，，，，pheatmap，，，，散落，，，，UMAP，，，，STACTPLOT3D，，，，林玛，，，，Stringr，grdevices，网格，统计
链接	RCPP
建议	生物基因，，，，尼特，，，，rcolorbrewer，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物使用
系统要求
增强
URL	http://www.r-project.orghttps://github.com/jhuanglab/flowspy
BugReports	https://github.com/jhuanglab/flowspy/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	flowspy_1.0.4.4.tar.gz
Windows二进制	flowspy_1.0.4.4.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	flowspy_1.0.4.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowspy
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/flowspy
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowspy/
软件包下载报告	下载统计