Flowspecs

doi：10.18129/b9.bioc.flowspecs

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Flowspecs。

处理高维细胞仪数据的工具

生物导体版本：3.10

该软件包旨在填补传统的细胞术预处理软件的作用，用于光谱分解，转换，可视化和清理，并通过启用FlowFrames和Flovsets转换到DataFrames来帮助进一步的下游分析，例如Depecher。管线中的符合流库自动1D门控/过滤的功能。已经选择了包装名称，因为它将处理光谱细胞仪，并且希望能为用户提供一对漂亮的眼镜来查看其数据。

作者：Jakob Theorell [AUT，CRE]

维护者：jakob theorell

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ flowspecs”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ flowspecs”）

html	R脚本	用于处理原始光谱细胞仪文件的示例工作流程
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	蜂窝基，，，，datarepresentation，，，，流程仪，，，，免疫学，，，，Singlecell，，，，软件，，，，可视化
版本	1.0.2
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（<6个月）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.6）
进口	GGPLOT2（> = 3.1.0），生物基因（> = 0.30.0），生物比较（> = 1.18.1），RESHAPE2（> = 1.4.3），流核（> = 1.50.0），动物园（> = 1.8.6），Stats（> = 3.6.0），方法（> = 3.6.0）
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，流量，，，，瓦肯，，，，Depecher
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/jtheorell/flowspecs/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	flowspecs_1.0.2.tar.gz
Windows二进制	flowspecs_1.0.2.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	flowspecs_1.0.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowspecs
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/flowspecs
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/flowspecs/
软件包下载报告	下载统计