啪嗒啪嗒地响

DOI:10.18129 / B9.bioc.flipflop

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此包适用于Bioconductor 3.10版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见啪嗒啪嗒地响．

基于套索的异构体快速预测作为流动问题

Bioconductor版本:3.10

Flipflop根据RNA-Seq读取数据，发现在给定样本中表达的基因亚型及其丰度。它接受SAM格式的对齐文件作为输入。它还可以同时发现来自多个样本的转录本，增加统计能力。

作者:Elsa Bernard, Laurent Jacob, Julien Mairal, Jean-Philippe Vert

维护者:Elsa Bernard < Elsa。Bernard在mines-paristech.fr>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("flipflop")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AlternativeSplicing，RNASeq，RNASeqData，回归，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)
进口	方法,矩阵，IRanges，GenomicRanges、并行
链接
建议	GenomicFeatures
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL	http://cbio.ensmp.fr/flipflop
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制	flipflop_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flipflop
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/flipflop
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/flipflop/
软件包下载报告	下载数据