fabia。

DOI:10.18129 / B9.bioc.fabia

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fabia。。

Bicluster收购FABIA:因子分析

Bioconductor版本:3.10

Bicluster收购Biclustering“因素分析”(FABIA。)。biclustering FABIA。是一种基于模型的技术,这是集群同时行和列。Biclusters因子分析发现,这两个因素和荷载矩阵是稀疏的。FABIA。是一个乘法模型,提取线性样本之间的依赖关系和功能模式。它捕获现实的非高斯数据分布与沉重的尾巴基因表达的观察测量。FABIA。利用好理解模型选择技术如EM算法和变分方法,嵌入到一个贝叶斯框架。FABIA biclusters排名根据他们的信息内容和分离假biclusters biclusters从如此。代码是用C写的。

作者:然而Hochreiter < hochreit在bioinf.jku.at >

维护人员:Andreas Mitterecker < Mitterecker在bioinf.jku.at >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fabia。”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“fabia。”)

PDF	R脚本	FABIA:手册R包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparison,软件,StatisticalMethod,可视化
版本	2.32.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(9.5年)
许可证	LGPL (> = 2.1)
取决于	R (> = 3.6.0),Biobase
进口	统计方法、图形grDevices,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/fabia/fabia.html
取决于我	hapFabia
进口我	miRSM
建议我	fabiaData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	fabia_2.32.0.tar.gz
Windows二进制	fabia_2.32.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	fabia_2.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fabia
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fabia
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fabia/
包下载报告	下载数据