此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见fCI.
Bioconductor版本:3.10
(f-divergence Cutoff Index),是在转录组和蛋白质组数据中寻找DEGs,通过计算对照-对照的折叠变化分布与剩余(无差异)病例-对照基因表达比数据的差异来识别DEGs。与现有方法相比,fCI提供了几个优点。
作者:唐少军
维护人员:唐绍军
引文(从R内,输入引用(fCI)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("fCI")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (fCI)
超文本标记语言 | R脚本 | fCI |
参考手册 |
biocViews | 蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.1),模糊神经网络,心理,gtools,动物园,rgl、网格维恩图 |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | fCI_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | fCI_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | fCI_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCI |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fCI |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fCI/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |