fCCAC

DOI:10.18129 / B9.bioc.fCCAC

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅fCCAC。

功能的典型相关分析来评估核酸测序数据集之间的协方差

Bioconductor版本:3.10

应用程序的功能的典型相关分析来评估协方差等核酸测序数据集的染色质免疫沉淀反应深度测序(ChIP-seq)紧随其后。可以使用包与其他类型的测序数据比如neMeRIP-seq (PMID: 29489750)或单个细胞RNA-seq大佬中提供或表观基因组数据格式。

作者:佩德罗情歌<生物信息学。工程师在gmail.com >

维护人员:佩德罗情歌<生物信息学。工程师在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“fCCAC”)

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文档

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细节

biocViews	报道,遗传学,测序,软件,转录
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.0),S4Vectors,IRanges,GenomicRanges、网格
进口	食品及药物管理局,RColorBrewer,genomation,ggplot2,ComplexHeatmap,统计grDevices跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
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包档案

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源包	fCCAC_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	fCCAC_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	fCCAC_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCCAC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ fCCAC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fCCAC/
包下载报告	下载数据