eudysbiome

DOI:10.18129 / B9.bioc.eudysbiome

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eudysbiome。

笛卡尔的情节和应急测试16 s微生物数据

Bioconductor版本:3.10

eudysbiome包,允许注释微分属有害或无害的基于他们的能力有助于宿主疾病(如表示在文学)或未知的基于模糊属的分类。此外,包统计措施eubiotic(无害的属增加或减少有害属)或dysbiotic(无害的属减少或增加有害属)给定治疗或环境变化的影响(gut-intestinal GI)微生物的微生物相比,参考条件。

作者:小袁,克里斯汀纳尔迪尼

维护人员:小袁周< zhouxiaoyuan picb.ac.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“eudysbiome”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“eudysbiome”)

PDF	R脚本	eudysbiome用户手册
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文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.1.0)
进口	plyr,Rsamtools,R.utils,Biostrings
链接
建议
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增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	eudysbiome_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	eudysbiome_1.16.0.zip(64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	eudysbiome_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eudysbiome
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ eudysbiome
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/eudysbiome/
包下载报告	下载数据