erccdashboard

DOI:10.18129 / B9.bioc.erccdashboard

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅erccdashboard。

评估差与ERCC控制基因表达的实验

Bioconductor版本:3.10

技术性能指标差异基因表达实验使用外部RNA控制的财团(ERCC)激增比例混合物。

作者:莎拉·芒罗,史蒂夫·隆德

维修工:莎拉·芒罗<萨拉。munro gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“erccdashboard”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“erccdashboard”)

PDF	R脚本	erccdashboard例子
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,BatchEffect,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,遗传学,ImmunoOncology,微阵列,MultipleComparison,质量控制,RNASeq,软件,转录,mRNAMicroarray
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2),ggplot2(> =魅惑,gridExtra(> = 2.0.0)
进口	刨边机,gplots、网格gtools,limma,locfit,质量,plyr,qvalue,reshape2,ROCR,尺度,stringr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/munrosa/erccdashboardhttp://tinyurl.com/erccsrm
BugReports	https://github.com/munrosa/erccdashboard/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	erccdashboard_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	erccdashboard_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	erccdashboard_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/erccdashboard
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ erccdashboard
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/erccdashboard/
包下载报告	下载数据