EPIVIZRSTANTALLONE

doi:10.18129/b9

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅EPIVIZRSTANTALLONE

在R中运行epiviz交互式基因组数据可视化应用程序

生物导体版本:3.10

该软件包将导入epiviz可视化JavaScript应用程序进行基因组数据交互式可视化。“ Epivizrserver”软件包用于提供完全在R中运行的Web服务器。此独立版本允许通过BioConductor软件包提供的基因组注释浏览任意基因组。

作者:Hector Corrada Bravo,Jayaram Kancherla

维护者:hector Corrada bravo

引用(从r内,输入引用(“ epivizrstandstalone”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ epivizrstance”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Epivizrstandantalone”)

html Epivizrstandarone简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 GUI,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.2.3),epivizr(> = 2.3.6),方法
进口 git2r,,,,Epivizrserver,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,GenomicFeatures,,,,S4VECTORS
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,有机体(> = 1.13.9),mus.musculus,,,,生物酶,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 metavizr
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epivizrstandation_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 EPIVIZRSTANDALONO_1.14.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) EPIVIZRSTANDALONE_1.14.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrstandstalone
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epivizrstandstalone
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrstandantalone/
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