Epigenomix.

DOI：10.18129 / b9.bioc.epigenomix

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Epigenomix.。

表观遗传和基因转录数据标准化与混合模型集成

生物导体版本：3.10

通过芯片-SEQ获得的RNA-SEQ或基于微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的封装。该包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及拟合贝叶斯混合模型的方法，以便检测两个数据类型差异的基因。

作者：Hans-Ulrich Klein，Martin Schaefer

维护者：Hans-Ulrich Klein

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“epigenomix”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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PDF.	r script.	Epigenomix包小插图
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	chipseq.那分类那不同的亚兴那基因表达那软件
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（7年）
执照	LGPL-3
依靠	R（> = 3.2.0），方法，BioBase.那S4Vectors.那绞喉那Genomicranges.那概括分析
进口	生物根系那McMcpack.那RSAMTOOLS.， 平行，Genomeinfodb.那Beadarray.
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包档案包

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源包	Epigenomix_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	epigenomix_1.26.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	EPIGENOMIX_1.26.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/epigenomix.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ epigenomix
包短网址	https://biocumon.org/packages/epigenomix/
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