Epigenomix.

DOI:10.18129 / b9.bioc.epigenomix

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Epigenomix.

表观遗传和基因转录数据标准化与混合模型集成

生物导体版本:3.10

通过芯片-SEQ获得的RNA-SEQ或基于微阵列基因转录和组蛋白修饰数据的封装。该包提供了用于数据预处理和匹配的方法以及拟合贝叶斯混合模型的方法,以便检测两个数据类型差异的基因。

作者:Hans-Ulrich Klein,Martin Schaefer

维护者:Hans-Ulrich Klein

引文(从R内,输入引文(“epigenomix”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“epigenomix”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“EPIGENOMIX”)

PDF. r script. Epigenomix包小插图
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. chipseq.分类不同的亚兴基因表达软件
版本 1.26.0
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(7年)
执照 LGPL-3
依靠 R(> = 3.2.0),方法,BioBase.S4Vectors.绞喉Genomicranges.概括分析
进口 生物根系McMcpack.RSAMTOOLS., 平行,Genomeinfodb.Beadarray.
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包档案包

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源包 Epigenomix_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件 epigenomix_1.26.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) EPIGENOMIX_1.26.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/epigenomix.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ epigenomix
包短网址 https://biocumon.org/packages/epigenomix/
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