这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eisa。
Bioconductor版本:3.10
迭代签名算法(ISA)是一个biclustering方法;找到相关的块(转录模块)基因表达的数据(或其他表格)。ISA能够找到重叠模块和噪音是有弹性的。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准BioConductor数据结构;也包含各种可视化工具,可以用于其他biclustering算法。
作者:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >
维护人员:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(eisa)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(eisa)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (eisa)
R脚本 | 基因表达数据的迭代签名算法 | |
参考手册 |
biocViews | 分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.38.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.6 (r - 2.11)(10年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | isa2,Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法 |
进口 | BiocGenerics,类别,genefilter,DBI |
链接 | |
建议 | igraph(> = 0.6),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | ExpressionView |
进口我 | ExpressionView |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | eisa_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | eisa_1.38.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | eisa_1.38.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ eisa |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/ |
包下载报告 | 下载数据 |