这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eegc。
Bioconductor版本:3.10
这个包了评估细胞工程流程直接分化的干细胞或转换主要细胞转分化的体细胞基于高通量基因表达数据筛选通过DNA微阵列或RNA序列。包从三种类型的基因表达谱作为输入样本:(i)体细胞或干细胞分化(反式)(工程过程的输入),(2)诱导细胞评估(工程过程的输出)和(3)目标主要细胞(参考输出)。计划执行差异基因表达分析每两两样本比较识别和评估样本的转录差异3类型(输入、输出、引用)。理想的目标是诱导和主要参考细胞显示重叠的概要文件,既不同于原始细胞。
作者:小袁,孟,克里斯汀·纳尔迪尼香港美地
维护人员:小袁周< zhouxiaoyuan picb.ac.cn >
从内部引用(R,回车引用(“eegc”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“eegc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“eegc”)
R脚本 | 基因工程评价的分类(eegc) | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression, |