此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见刨边机.
Bioconductor版本:3.10
生物复制RNA-seq表达谱的差异表达分析。实现了一系列基于负二项分布的统计方法,包括经验贝叶斯估计、精确检验、广义线性模型和准似然检验。除了RNA-seq,它还可以应用于其他类型的基因组数据的差分信号分析,包括ChIP-seq, Bisulfite-seq, SAGE和CAGE。
作者:陈云顺,Aaron TL伦,Davis J McCarthy, Matthew E Ritchie, Belinda Phipson,胡一芳,周晓北,Mark D Robinson, Gordon K Smyth
维护者:陈云顺
引文(从R内,输入引用(磨边机)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("edgeR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(磨边机)
磨边机装饰图案 | ||
edgeRUsersGuide.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | edgeR_3.28.1.tar.gz |
Windows二进制 | edgeR_3.28.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | edgeR_3.28.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edgeR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/edgeR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/edgeR/ |
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