drawProteins

DOI:10.18129 / B9.bioc.drawProteins

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见drawProteins

从Uniprot API输出中绘制蛋白质示意图的包

Bioconductor版本:3.10

这个包从Uniprot API输出中绘制蛋白质原理图。从GET命令返回的JSON中,它从Uniprot Features API创建了一个数据帧。然后,基于ggplot2和碱基R的geoms可以使用这个数据帧来绘制蛋白质示意图。

作者:保罗·布伦南[aut, cre]

维护者:Paul Brennan

引文(从R内,输入引用(“drawProteins”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("drawProteins")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“drawProteins”)

超文本标记语言 R脚本 使用drawProteins
超文本标记语言 R脚本 在drawProteins中使用extract_transcripts
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews FunctionalPrediction蛋白质组学软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(2年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.4)
进口 ggplot2httrdplyrreadrstringrtidyr
链接
建议 covrtestthatknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins
BugReports https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins/issues/new
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 drawProteins_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 drawProteins_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) drawProteins_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawProteins
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/drawProteins
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/drawProteins/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网