derfinderPlot

DOI:10.18129 / B9.bioc.derfinderPlot

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见derfinderPlot．

derfinder的绘图函数

Bioconductor版本:3.10

这个包为derfinder包的结果提供绘图功能。

作者:Leonardo Collado-Torres [aut, cre]安德鲁·e·贾菲[书]，杰弗里·t·里克[aut, th]

维护人员:Leonardo Collado-Torres

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“derfinderPlot”)

超文本标记语言	R脚本	介绍derfinderPlot
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.2)
进口	derfinder(> = 1.1.0版),GenomeInfoDb(> = 1.3.3),GenomicFeatures，GenomicRanges(> = 1.17.40),ggbio(> = 1.13.13),ggplot2、图形、grDevicesIRanges(> = 1.99.28),limma、方法、plyr，RColorBrewer，reshape2，S4Vectors(> = 0.9.38),尺度,跑龙套
链接
建议	biovizBase(> = 1.27.2),bumphunter(> = 1.7.6),derfinderData(> = 0.99.0),sessioninfo，knitcitations(> = 1.0.1),knitr(> = 1.6),BiocStyle(> = 2.5.19),org.Hs.eg.db，RefManageR，rmarkdown(> = 0.3.3),testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/leekgroup/derfinderPlot
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/derfinderPlot
取决于我
进口我	brainflowprobes，recountWorkflow
建议我	derfinder，GenomicState，regionReport
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	derfinderPlot_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	derfinderPlot_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	derfinderPlot_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderPlot
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ derfinderPlot
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderPlot/
包下载报告	下载数据