deltaCaptureC

DOI:10.18129 / B9.bioc.deltaCaptureC

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅deltaCaptureC。

这个包从3 c数据发现中尺度染色质重塑

Bioconductor版本:3.10

这个包从3 c数据发现中尺度染色质重塑。3 c数据在本质上是局部的。它吉文斯之间的交互项限制性内切酶消化碎片和地区首选的“观点”。通过装箱数据和使用排列测试,这个包可以测试是否有统计学意义的变化之间的交互项数据从两个细胞类型或两个治疗方法。

作者:迈克尔·夏皮罗(aut (cre)

维护人员:迈克尔·夏皮罗在earthlink.net < sifka >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“deltaCaptureC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“deltaCaptureC”)

HTML	R脚本	三角洲俘获
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	BiologicalQuestion,软件,StatisticalMethod
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6)
进口	IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,ggplot2,DESeq2
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	deltaCaptureC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	deltaCaptureC_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	deltaCaptureC_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deltaCaptureC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ deltaCaptureC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/deltaCaptureC/
包下载报告	下载数据