此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅装饰。
生物导体版本:3.10
该软件包通过两步方法(包括limma and NSCA)的两步方法发现了异质和均质imic数据中的差异特征。DECO揭示了与隐藏子类不仅与较高的放松管制水平相关的隐藏子类的功能关联。
作者:Francisco Jose Campos-Laborie,Jose Manuel Sanchez-Santos和Javier de Las Rivas。生物信息学和功能基因组学组。癌症研究中心(CIC-IBMCC,CSIC/USAL)。萨拉曼卡。西班牙。
维护者:francisco jose Campos Labie
引用(从r内,输入引用(“装饰”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ deco”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Deco”)
html | R脚本 | 装饰 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,生物医学信息学,,,,聚类,,,,差异性,,,,exonarray,,,,特征提取,,,,基因表达,,,,MicroRNAARRAY,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,蛋白质组学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学,,,,Mrnamicroarray |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(1年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | r(> = 3.5.0),AnnotationDbi,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,林玛 |
进口 | 统计,方法,GGPLOT2,,,,外国的,图形,生物使用,,,,生物酶,,,,簇,,,,GPLOTS,,,,rcolorbrewer,,,,Locfit,,,,制造4,,,,ADE4,,,,sfsmisc,,,,STACTPLOT3D,,,,gdata,grdevices,utils,RESHAPE2,,,,栅格 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,策展,,,,多亚sayExexperiment,,,,同性恋 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/fjcamlab/deco |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | deco_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | deco_1.2.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | deco_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deco |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/装饰 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/deco/ |
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