debCAM

DOI:10.18129 / B9.bioc.debCAM

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅debCAM。

反褶积凸分析的混合物

Bioconductor版本:3.10

R包完全无监督反褶积的复杂组织。它提供基本功能对混合物进行无监督反褶积表达谱凸分析的混合物(CAM)和一些辅助功能来帮助理解subpopulation-specific结果。它还实现了功能来执行监督反褶积基于先验知识分子标记,S矩阵或矩阵。结合分子标记从凸轮和先验知识可以实现semi-supervised反褶积的混合物。

作者:陈露露< luluchen vt.edu >

维护人员:露露陈< luluchen vt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“debCAM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“debCAM”)

HTML	R脚本	debCAM用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,GeneExpression,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5)
进口	方法,rJava,BiocParallel统计数据,Biobase,SummarizedExperiment,corpcor,几何,NMF,nnls,DMwR,pcaPP,apcluster、图形
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat,GEOquery,rgl
SystemRequirements	Java (> = 1.8)
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Lululuella/debCAM/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	debCAM_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	debCAM_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	debCAM_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/debCAM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ debCAM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/debCAM/
包下载报告	下载数据