DDCT
doi：10.18129/b9.bioc.ddct
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅DDCT。
用于分析定量实时PCR（QRT-PCR）的DDCT算法
生物导体版本：3.10
Delta-Delta-CT（DDCT）算法是一种近似方法，用于确定具有定量实时PCR（QRT-PCR）实验的相对基因表达。与其他方法相比，它不需要每个引物目标对，因此不需要标准曲线，因此减少了工作载荷，但只要放大效率的假设，就可以返回足够的准确结果。DDCT软件包实现了一条管道来收集，分析和可视化QRT-PCR结果，例如Taqman SDM软件的管道，主要使用DDCT方法。可以通过命令行中的脚本或通过由S4类，方法和功能组成的API调用管道。
作者：Jitao David Zhang，Rudolf Biczok和Markus Ruschhaupt
维护者：Jitao David Zhang
引用（从r内，输入引用（“ DDCT”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ddct”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ddct”）
| R脚本 | 使用DDCT软件包中的端到端脚本分析RT-PCR数据 | |
| R脚本 | 如何应用DDCT方法 | |
| R脚本 | QRT-PCR数据分析的DDCT方法简介：背景，算法和示例 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，MicrotReplateassay，，，，软件，，，，qpcr |
| 版本 | 1.42.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.5（R-2.10）（10。5年） |
| 执照 | LGPL-3 |
| 要看 | r（> = 2.3.0），方法 |
| 进口 | 生物酶（> = 1.10.0），rcolorbrewer（> = 0.1-3），Xtable，，，，格子，，，，生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ddct_1.42.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ddct_1.42.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ddct_1.42.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddct |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ddct |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ddct/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
