dSimer

DOI:10.18129 / B9.bioc.dSimer

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此包适用于Bioconductor 3.10版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见dSimer

疾病相似度方法的整合

Bioconductor版本:3.10

dSimer是一个R包,它提供了9种度量疾病相似度的方法的计算,包括一个标准余弦相似度度量和8种基于函数的方法。这9种方法得到的疾病相似度矩阵可以通过热图和网络进行可视化。dSimer还提供了广泛用于疾病-疾病关联研究的生物学数据。

作者:李敏<丽敏at mail.csu.edu.cn>,倪鹏,费志辉、黄萍投稿。

维护者:彭妮

引文(从R内,输入引用(“dSimer”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("dSimer")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews 网络软件可视化
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.3.0),igraph(> = 1.0.1)
进口 统计数据,Rcpp(> = 0.11.3),ggplot2reshape2GO.dborg.Hs.eg.dbAnnotationDbi、图形
链接 Rcpp
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制 dSimer_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) dSimer_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dSimer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dSimer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/dSimer/
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