这个包裹是弃用.它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。
此包适用于Bioconductor 3.10版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见dSimer.
Bioconductor版本:3.10
dSimer是一个R包,它提供了9种度量疾病相似度的方法的计算,包括一个标准余弦相似度度量和8种基于函数的方法。这9种方法得到的疾病相似度矩阵可以通过热图和网络进行可视化。dSimer还提供了广泛用于疾病-疾病关联研究的生物学数据。
作者:李敏<丽敏at mail.csu.edu.cn>,倪鹏
维护者:彭妮
引文(从R内,输入引用(“dSimer”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("dSimer")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | 网络,软件,可视化 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.3.0),igraph(> = 1.0.1) |
进口 | 统计数据,Rcpp(> = 0.11.3),ggplot2,reshape2,GO.db,org.Hs.eg.db,AnnotationDbi、图形 |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | dSimer_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | dSimer_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dSimer |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dSimer |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dSimer/ |
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