cydar

DOI:10.18129 / B9.bioc.cydar

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cydar。

使用质量血细胞计数微分丰度分析

Bioconductor版本:3.10

识别不同样本和组之间丰富的人口质量血细胞计数数据。提供方法来计算细胞超球面,控制空间错误发现率和可视化的变化丰富的高维空间标志。

作者:亚伦Lun (aut (cre)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cydar”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cydar”)

HTML	R脚本	检测不同丰富的亚种群质量血细胞计数数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	FlowCytometry,ImmunoOncology,MultipleComparison,蛋白质组学,SingleCell,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	BiocParallel,SingleCellExperiment
进口	冬青、方法、闪亮的、图表、数据、grDevices跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,flowCore,Biobase,Rcpp,BiocNeighbors,SummarizedExperiment
链接	Rcpp
建议	ncdfFlow,testthat,knitr,刨边机,limma,glmnet,BiocStyle,flowStats
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cydar_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	cydar_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cydar_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cydar
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cydar/
包下载报告	下载数据