consensusSeekeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.consensusSeekeR

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅consensusSeekeR。

共识的检测区域内的一组经验使用基因位置和基因组范围

Bioconductor版本:3.10

这个包比较基因组位置和基因组范围从多个实验提取共同的地区。分析区域的大小可调的数量以及经验的特性必须出现在一个潜在的区域标记该地区作为一个共识。

作者:阿斯特丽德Deschenes (cre, aut),法比克劳德无痛分娩法[所有],帕斯卡Belleau (aut) Arnaud所有权(aut)

维护人员:阿斯特丽德Deschenes < adeschen hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“consensusSeekeR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“consensusSeekeR”)

HTML	R脚本	共识的检测区域内的一组实验
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion,ChIPSeq,报道,遗传学,MultipleComparison,PeakDetection,测序,软件,转录
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),BiocGenerics,IRanges,GenomicRanges,BiocParallel
进口	GenomeInfoDb,rtracklayer,stringr,S4Vectors、方法
链接
建议	BiocStyle,ggplot2,knitr,rmarkdown,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ArnaudDroitLab/consensusSeekeR
BugReports	https://github.com/ArnaudDroitLab/consensusSeekeR/issues
取决于我
进口我	RJMCMCNucleosomes
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	consensusSeekeR_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	consensusSeekeR_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	consensusSeekeR_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusSeekeR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ consensusSeekeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/consensusSeekeR/
包下载报告	下载数据