此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Compepitools。
生物导体版本:3.10
开发了用于分析,集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(EPI)基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。
作者:Mattia Pelizzola [AUT],Kamal Kishore [AUT,CRE]
维护者:kamal kishore
引用(从r内,输入引用(“ Compepitools”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ compepitools”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ compepitools”)
R脚本 | compepitools.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年) |
执照 | GPL |
要看 | r(> = 3.1.1),方法,topgo,,,,基因组机 |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,rsamtools,并行,grdevices,GPLOTS,,,,iranges,,,,GenomicFeatures,,,,xvector,,,,甲基管,,,,go.db,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB |
链接 | |
建议 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db,,,,尼特,,,,rtracklayer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | compepitools_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | compepitools_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | compepitools_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compepitools |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/compepitools |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compepitools/ |
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