Compepitools

doi:10.18129/b9.bioc.compepitools

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Compepitools

计算表观基因组学的工具

生物导体版本:3.10

开发了用于分析,集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(EPI)基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。

作者:Mattia Pelizzola [AUT],Kamal Kishore [AUT,CRE]

维护者:kamal kishore

引用(从r内,输入引用(“ Compepitools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ compepitools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ compepitools”)

PDF R脚本 compepitools.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年)
执照 GPL
要看 r(> = 3.1.1),方法,topgo,,,,基因组机
进口 AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,rsamtools,并行,grdevices,GPLOTS,,,,iranges,,,,GenomicFeatures,,,,xvector,,,,甲基管,,,,go.db,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB
链接
建议 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db,,,,尼特,,,,rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 compepitools_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 compepitools_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) compepitools_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compepitools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/compepitools
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/compepitools/
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