Cobindr

doi:10.18129/b9.bioc.cobindr

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Cobindr

查找转录因子结合位点的共配合基序

生物导体版本:3.10

在基因组中查找和分析转录因子结合位点的共配合基序

作者:Manuela Benary,Stefan Kroeger,Yuehien Lee,Robert Lehmann

维护者:Manuela Benary

引用(从r内,输入引用(“ Cobindr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cobindr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cobindr”)

PDF R脚本 使用Cobindr
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 细胞生物学,,,,chipseq,,,,多重组合,,,,测序,,,,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年)
执照 艺术2.0
要看
进口 方法,seqinr,,,,Yaml,rtfbs,GPLOTS,,,,mclust,,,,GMP,,,,生物基因(> = 0.13.8),iranges,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,Biomart
链接
建议 运行
系统要求
增强 rgadem,,,,seqlogo,,,,Genoplotr, 平行,Venndiagram,,,,rcolorbrewer,,,,VCD,,,,主题,,,,降雪
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cobindr_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 cobindr_1.24.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) cobindr_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cobindr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cobindr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cobindr/
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