此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Cobindr。
生物导体版本:3.10
在基因组中查找和分析转录因子结合位点的共配合基序
作者:Manuela Benary,Stefan Kroeger,Yuehien Lee,Robert Lehmann
维护者:Manuela Benary
引用(从r内,输入引用(“ Cobindr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cobindr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Cobindr”)
R脚本 | 使用Cobindr | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 细胞生物学,,,,chipseq,,,,多重组合,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | |
进口 | 方法,seqinr,,,,Yaml,rtfbs,GPLOTS,,,,mclust,,,,GMP,,,,生物基因(> = 0.13.8),iranges,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,Biomart |
链接 | |
建议 | 运行 |
系统要求 | |
增强 | rgadem,,,,seqlogo,,,,Genoplotr, 平行,Venndiagram,,,,rcolorbrewer,,,,VCD,,,,主题,,,,降雪 |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cobindr_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | cobindr_1.24.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | cobindr_1.24.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cobindr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cobindr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cobindr/ |
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