cn.farms

DOI:10.18129 / B9.bioc.cn.farms

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cn.farms。

cn。农场——因子分析拷贝数的估计

Bioconductor版本:3.10

这个包实现了cn。农场拷贝数变异(CNV)算法分析。cn。农场可以分析最常见Affymetrix (250 k-snp6.0)数组类型,支持使用雪和ff高性能计算。

作者:Andreas Mitterecker Djork-Arne Clevert

维护人员:Andreas Mitterecker < Mitterecker在bioinf.jku.at >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cn.farms”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cn.farms”)

PDF	R脚本	cn.farms: Manual for the R package
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,软件
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(9年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 3.0),Biobase、方法、ff,oligoClasses,雪
进口	DBI,affxparser,益生元,DNAcopy,preprocessCore,晶格
链接
建议	pd.mapping250k.sty,pd.mapping250k.nsp,pd.genomewidesnp.5,pd.genomewidesnp.6
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cn.farms_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	cn.farms_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cn.farms_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cn.farms
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cn.farms
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/
包下载报告	下载数据